Размер:
A A A
Цвет: C C C
Изображения Вкл. Выкл.
Обычная версия сайта

Федеральный исследовательский центр 
«Красноярский научный центр
Сибирского отделения Российской академии наук»

Лаборатория цифровых управляемых лекарств и роботизированных систем тераностики

06.06.2018 г.

Лаборатория цифровых.jpg

Разработка новых средств диагностики и терапии на основе ДНК аптамеров. Селекция аптамеров к биологическим мишеням. Идентификация молекулярных мишеней аптамеров. Исследование трехмерной структуры аптамеров и моделирование их взаимодействий с мишенями. Магнитодинамическая терапия онкологических заболеваний. Микрофлюидные технологии. Протеомика.

Основные направления

  • Селекция ДНК аптамеров к биологическим мишеням.
  • Обработка результатов селекции аптамеров с помощью биоинформационных методов.
  • Магнитодинамическая терапия онкологических заболеваний.
  • Интраоперационное окрашивание опухолей.
  • Микрофлюидные технологии.
  • Исследование трехмерной структуры аптамеров методом малоуглового рассеяния.
  • Идентификация молекулярных мишеней аптамеров и целевой поиск новых биомаркеров.
  • Трехмерное моделирование взаимодействий аптамеров с мишенями методом молекулярного докинга.
  • Протеомные исследования для создания новых диагностических систем.

Основные достижения

  • Методом SELEX получены ДНК аптамеры к различным мишеням – асцитной карциноме Эрлиха, возбудителям сальмонеллеза, тканям рака легкого, глиомы, рака молочной железы.
  • Разработаны программные средства для обработки результатов полногеномного секвенирования пулов аптамеров, полученных в результате селекции, для выбора и дальнейшего использования наиболее эффективных нуклеотидных последовательностей.
  • На мышиной модели разработана и протестирована система магнитодинамической терапии опухолей с использованием ДНК аптамеров и магнитных частиц.
  • На основе аптамера к глиоме Gli-233 разработан флюоресцентный спрей для интраоперационного окрашивания опухолей головного мозга.
  • Разработана методика получения пространственной структуры ДНК аптамеров с помощью метода малоуглового рентгеновского рассеяния.
  • Разработан метод идентификации молекулярных мишеней аптамеров с помощью аффинного обогащения и масс-спектрометрии высокого разрешения.
  • С помощью молекулярного докинга были определены возможные места связывания аптамера к глиоме Gli-233 с модифицированным в раковых клетках человеческим тубулином.
  • На основе протеомного профилирования и математической обработки полученных данных разработаны концепции прогнозных и дифференциальных диагностических систем для больных хроническим лимфолейкозом и болезнями почек.

Методы исследований

  • Селекция ДНК аптамеров с помощью методов SELEX, cell-SELEX, tissue-SELEX.
  • Полимеразная цепная реакция (ПЦР), проточная цитометрия, гель-электрофорез, оптическая и конфокальная микроскопия, микрофлюидные системы.
  • Математическая обработка результатов полногеномного секвенирования пулов аптамеров, результатов протеомного анализа с помощью статистического и регрессионного анализа, машинного обучения.
  • Малоугловое рентгеновское рассеяние (МУРР).
  • Молекулярный докинг.
  • Масс-спектрометрия высокого разрешения.

Сотрудники

 КичкайлоАС.jpg Заведующая лабораторией
Кичкайло Анна Сергеевна
доктор биологических наук
ведущий научный сотрудник

+7 903 9238402
annazamay@yandex.ru
aszamay@gmail.com




Поделиться:


Наверх
Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук»
РоссияКрасноярскКрасноярский край660036, г. Красноярск, ул. Академгородок, 50
+7 (391) 290-79-88fic@ksc.krasn.ru55.99178392.765381