Направления исследований.

Группа молекулярно-генетических исследований под руководством ведущего научного сотрудника, к.б.н. Смольниковой Марины Викторовны, занимается разработкой персонифицированных прогностических критериев ранней диагностики и терапии заболеваний человека, а также популяционной генетикой.

Изучение основ патогенеза заболеваний является перспективным в связи с генетической детерминированностью большинства заболеваний. Поиск и выделение маркеров возникновения патологии, предрасположенности к тяжелому течению дает основу для профилактики и ранней диагностики социально-значимых заболеваний, возможности предотвращения инвалидизации и утраты работоспособности населения.

Задачи и достижения.

За время существования молекулярно-генетического направления в НИИ МПС создан уникальный банк ДНК коренных народностей арктических территорий Красноярского края (ненцы, долгане-нганасане) (около 1000 образцов). Также банк ДНК здоровых лиц славянского происхождения и больных МФЗ (бронхиальная астма, псориаз) (около 700 образцов).

С 2018 года группа является соисполнителем международного проекта с мировым уровнем значимости “GenomeAsia100K”, результатом которого станут результаты популяционного скрининга геномов азиатских популяций. В рамках проекта проводится изучение происхождения Ненцев и Долган, их родство с другими сибирскими популяциями, а также динамика популяций и миграции в ходе многотысячной истории коренных народов Сибири.

В 2014-2017 г.г. сотрудники группы являлись основными исполнителями проекта «Этнически ассоциированные факторы риска высокого уровня младенческой смертности у детей коренного населения Крайнего Севера: поисковое исследование генетической предрасположенности к инфекционным заболеваниям», который выполнялся в рамках Программы фундаментальных исследований Президиума РАН «Поисковые фундаментальные научные исследования в интересах развития Арктической зоны Российской Федерации». Получены пилотные данные участия генов лектинового пути комплемента в подверженности младенцев к инфекционным заболеваниям в зависимости от этнической принадлежности.

За 10 лет по результатам молекулярно-генетических исследований опубликовано более 100 научных публикаций в журналах, индексируемых WoS, Scopus, РИНЦ. Ежегодно принимается участие в международных и всероссийских конгрессах с докладами результатов собственных исследований.

Основное оборудование.

Амплификатор Rotor Gene Q 6-plex (Qiagen). Позволяет осуществлять полимеразную цепную реакциию в режиме real-time. Используется для качественного и количественного анализа ДНК и РНК.

Ультрасовременная система для цифровой ПЦР (dPCR) QIAcuity One (Qiagen). Цифровая ПЦР нацелена на обнаружение мутаций, генотипирование SNP, варьирование количества копий ДНК, анализ микробиома и обнаружение патогена, анализ экспрессии генов, проверку секвенирования нового поколения, обнаружение редактирования генов.

Анализатор NanoDrop One (ThermoScientific). Позволяет измерять концентрацию и чистоту нуклеиновых кислот и белков.

Флюориметр Qubit 4 (ThermoFisher Scientific). Позволяет измерять концентрацию ДНК, РНК и белков с использованием специальных реактивов.

Мультиплексный иммуноанализатор MagPix (Luminex xMap technology, Merck). Позволяет анализировать более 100 мишеней в одном образце, в микрообъеме (10-12 мкл). Система MagPix применяется для решения задач молекулярной и клеточной биологии, для изучения профилей биомаркеров (гормоны, регуляторные белки, цитокины и т.п.).

Амплификаторы «Терцик» и вспомогательное оборудование для экстракции нуклеиновых кислот, для проведения электрофоретической детекции продуктов рестрикции.

В задачи группы входит взаимодействий и планирование совместных исследований с лабораториями НИИ МПС, ФИЦ КНЦ СО РАН, а также других НИИ (в их число входит ИЦИГ, г. Новосибирск, НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ, НИИФ клинической иммунологии, г. Новосибирск и др.), мониторинг мировых исследований в области иммуногенетических исследований, разработка новых протоколов исследований.

На данный момент в состав группы входят руководитель, два младших научных сотрудника, лаборант-исследователь. Мы ищем новые кадры, которые заинтересованы в развитии генетики, персонифицированной медицине и научных исследованиях в целом.