Основное направление деятельности клинического отделения патологии пищеварительной системы взрослых и детей - изучение распространенности, факторов риска, этно-экологических и патогенетических аспектовзаболеваний желудочно-кишечного тракта у взрослого и детского населения для повышения эффективности ранней диагностики, профилактики и лечения патологии. Особое внимание уделяется изучению предраковых заболеванийорганов пищеварения.

Основные направления исследований:
Исследования с позиций этно-экологической гастроэнтерологии дестабилизирующего влияния экстремальных климатических условий Севера на адаптивные регуляторные системы, морфо-гистологические и клинико-биохимические, иммунологические параметры здоровья, заболеваемость и смертность.
Исследование дифференциации в распространенности заболеваний органов пищеварения в различных регионах Сибири среди пришлого и коренного населения у взрослых и детей.
Исследования инфекционных факторов, традиционно имеющих высокий эпидемиологический потенциал среди жителей Севера: изучение особенностей Нelicobacter рylori - ассоциированной патологии в связи с высокой распространенностью этой бактериальной инфекции и ее возможной ассоциацией с формированием атрофических и метапластических процессов в слизистой оболочке и вероятным развитием рака желудка.
Клинико-эпидемиологические исследования гастроэзофагеальной рефлюксной болезни (ГЭРБ) и предраковых изменений в слизистой оболочке пищевода, актуальные в связи с нарастанием распространенности патологии пищевода, в том числе, - онкологической (аденокарциномы пищевода).
Изучение клинико-лабораторных и морфологических особенностей патологии печени и желчевыводящих путей, имеющих значимость вследствие высокой распространенности вирусных, паразитарных и метаболических заболеваний гепатобилиарной зоны и их ассоциации со злокачественными новообразованиями.
Проспективное наблюдение пациентов разного возраста и установление распространенности и факторов риска гастроэнтерологических заболеваний у детей, что позволяет разрабатывать и оптимизироватьраннюю профилактику патологии уже в детском возрасте.

Основные достижения: 
Выполняется научная тема «Распространенность, факторы риска и клинические проявления предраковых изменений пищевода и желудка у коренных и пришлых жителей различных регионов Восточной Сибири в онтогенезе», которая включает 11 научных задач.
Ведется работа по темепоисковых научных исследований «Распространенность, факторы риска и клинические проявления предраковых изменений желудочно-кишечного тракта»
Разработан способ прогнозирования неблагоприятного течения гастроэзофагеальной рефлюксной болезни.
Совместно с лабораторией клинической патофизиологии разработана методика прогнозирования хронического гастрита, ассоциированного с инфекцией Helicobacter pylori.
На основании комплексных исследований с лабораторией клеточно-молекулярной физиологии и патологии разработан способ прогнозирования исхода острого вирусного гепатита В.
Сотрудниками отделения издано 10 монографий, более 400 публикаций, индексируемых в РИНЦ, 5 патентов. Сотрудники лаборатории активно представляют результаты своей научной деятельности в работе международных, Всероссийских и региональных конференций.

Основные приборы и оборудование: 
Фиброэзофагогастродуоденоскопы OLYMPUS EVISE xera II GIF-180 (Япония) с биопсийными щипцами;
Инфракрасный изотопный анализатор IRISDOC (Wagner Analysen Technik Gmb H, Германия) для определения HelicobacterpyloriC13-уреазным дыхательным тестом;
Ультразвуковая система Aixplorer (Supersonic Imagine, Франция) для эластометрии печени;
Микроскопы, микротомы и оборудование для морфологических исследований.

Методы исследований:
Эпидемиологический метод - совокупность различных методических приемов и способовдля анализа распространенности, факторов риска и клинических особенностей заболеваний пищеварительной системы у населения различных территорий и в разных этнических группах.
Гистологический и иммуногистохимический методы – изучение структуры и клеточного состава слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта.
C13-уреазный дыхательный тест – метод неинвазивной диагностики инфекции Helicobacterpylori
Эластометрия печени – неинвазивный метод для определения степени фиброза в ткани печени.
Иммуноферментный анализ – для определения в сыворотке крови пепсиногенов, антител к Helicobakter pylori и т.д.
Биохимические методы исследования крови и желчи.