Размер:
A A A
Цвет: C C C
Изображения Вкл. Выкл.
Обычная версия сайта
EN

Федеральный исследовательский центр 
«Красноярский научный центр
Сибирского отделения Российской академии наук»

 Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук»

Федеральный исследовательский центр 
«Красноярский научный центр
Сибирского отделения Российской академии наук»

Лаборатория цифровых управляемых лекарств и тераностики

06.06.2018 г.

Лаборатория цифровых.jpg

Разработка новых средств диагностики и терапии на основе ДНК аптамеров. Селекция аптамеров к биологическим мишеням. Идентификация молекулярных мишеней аптамеров. Исследование трехмерной структуры аптамеров и моделирование их взаимодействий с мишенями. Магнитодинамическая терапия онкологических заболеваний. Микрофлюидные технологии. Протеомика.

Основные направления

  • Селекция ДНК аптамеров к биологическим мишеням.
  • Обработка результатов селекции аптамеров с помощью биоинформационных методов.
  • Магнитодинамическая терапия онкологических заболеваний.
  • Интраоперационное окрашивание опухолей.
  • Микрофлюидные технологии.
  • Исследование трехмерной структуры аптамеров методом малоуглового рассеяния.
  • Идентификация молекулярных мишеней аптамеров и целевой поиск новых биомаркеров.
  • Трехмерное моделирование взаимодействий аптамеров с мишенями методом молекулярного докинга.
  • Протеомные исследования для создания новых диагностических систем.

Основные достижения

  • Методом SELEX получены ДНК аптамеры к различным мишеням – асцитной карциноме Эрлиха, возбудителям сальмонеллеза, тканям рака легкого, глиомы, рака молочной железы.
  • Разработаны программные средства для обработки результатов полногеномного секвенирования пулов аптамеров, полученных в результате селекции, для выбора и дальнейшего использования наиболее эффективных нуклеотидных последовательностей.
  • На мышиной модели разработана и протестирована система магнитодинамической терапии опухолей с использованием ДНК аптамеров и магнитных частиц.
  • На основе аптамера к глиоме Gli-233 разработан флюоресцентный спрей для интраоперационного окрашивания опухолей головного мозга.
  • Разработана методика получения пространственной структуры ДНК аптамеров с помощью метода малоуглового рентгеновского рассеяния.
  • Разработан метод идентификации молекулярных мишеней аптамеров с помощью аффинного обогащения и масс-спектрометрии высокого разрешения.
  • С помощью молекулярного докинга были определены возможные места связывания аптамера к глиоме Gli-233 с модифицированным в раковых клетках человеческим тубулином.
  • На основе протеомного профилирования и математической обработки полученных данных разработаны концепции прогнозных и дифференциальных диагностических систем для больных хроническим лимфолейкозом и болезнями почек.

Методы исследований

  • Селекция ДНК аптамеров с помощью методов SELEX, cell-SELEX, tissue-SELEX.
  • Полимеразная цепная реакция (ПЦР), проточная цитометрия, гель-электрофорез, оптическая и конфокальная микроскопия, микрофлюидные системы.
  • Математическая обработка результатов полногеномного секвенирования пулов аптамеров, результатов протеомного анализа с помощью статистического и регрессионного анализа, машинного обучения.
  • Малоугловое рентгеновское рассеяние (МУРР).
  • Молекулярный докинг.
  • Масс-спектрометрия высокого разрешения.

Сотрудники

 КичкайлоАС.jpg Заведующая лабораторией
Кичкайло Анна Сергеевна
доктор биологических наук
ведущий научный сотрудник

+7 903 9238402
kichkailo.as@ksc.krasn.ru
annazamay@yandex.ru
aszamay@gmail.com




Поделиться:


Наверх